W latach 90. reprezentacja dwukrotnie awansowała do Mistrzostw Europy (1996 i 2004) i trzykrotnie do Mistrzostw Świata (1998, 2002 i 2006). Największe sukcesy odniosła na Mundialu 1998, kiedy to drużyna prowadzona przez Miroslava Blaževića zdobyła brązowy medal, a Davor Šuker został królem strzelców turnieju oraz w 2018 roku kiedy to Chorwacja zdobyła srebrny medal ulegając w finale Francji.