Swoją piłkarską karierę rozpoczynał w Motorze Lublin, gdzie w pierwszym zespole zadebiutował w wieku zaledwie 16 lat; dwa sezony później stał się podstawowym zawodnikiem. Następnie przeniósł się do drużyny Lecha Poznań, gdzie już w pierwszym sezonie wywalczył tytuł mistrza Polski; dobre występy Bąka zostały zauważone przez ówczesnego trenera reprezentacji Polski Andrzeja Strejlaua, który dał szansę debiutu młodemu piłkarzowi w meczu z Cyprem.

Latem roku 1995 Bąk przeszedł z drużyny Lecha do Olympique Lyon - pobyt w czołowej drużynie francuskiej ekstraklasy nie był dla niego zbyt udany ze względu na liczne kontuzje. Z pomocą przyszli jednak działacze RC Lens, którzy najpierw wypożyczyli, a później wykupili polskiego piłkarza. Ten odpłacił im się wieloma dobrymi występami, szczególnie w rozgrywkach elitarnej Ligi Mistrzów. W sierpniu 2005 rozwiązał kontrakt z Lens i przeszedł do vicemistrza ligi katarskiej - Al-Rayyan Doha. W czerwcu 2007 roku przeszedł do Austrii Wiedeń na zasadzie wolnego transferu. Dysponuje wyśmienitymi jak na obrońcę warunkami fizycznymi (194cm, 87kg)

Jacek Bąk regularnie występuje w Polskiej reprezentacji, zaliczając również występy na Mistrzostwach Świata w Korei i Japonii i walcząc obecnie o awans do Mundialu w 2006.